Połączenie z KSeF jest inicjowane w procedurze zalogowania / uwierzytelnienia osoby operatora programu i kontynuowane jest aż do wygaśnięcia lub usunięcia specjalnych tokenów dostępowych które program przechowuje. tokeny wygasają same w ciągu siedmiu dni, a ich usunięcie jest realizowane przez funkcję "Wyloguj"

Procedura zalogowania jest realizowana w kontekście firmy, której NIP musi być wpisany w Ustawieniach programu (Plik -> Ustawienia) i polega na potwierdzeniu tożsamości przez osobę (operatora programu), która musi mieć stosowne uprawnienia.

Zalogowanie wykonuje się przez:

1. Kliknięcie ikony KSeF na belce tytułowej głównego okna lub w menu KSeF -> Konsola KSeF.

2. Wybór metody logowania: (Podpis elektroniczny/ Certyfikat KSeF).

3. Kliknięcie na "Zaloguj" i wykonanie procedury zależnej od metody logowania.

4a. (Podpis elektroniczny) Procedura obejmuje logowanie profilem zaufanym lub podpisem kwalifikowanym. Należy podpisać elektronicznie plik "AuthRequest.xml" zgodnie z wyświetlaną instrukcją.

4b. (Certyfikat KSeF) Procedura polega na uzupełnieniu listy certyfikatów o swój certyfikat do uwierzytelniania w KSeF gdy brak takiego na liście (przycisk Importuj certyfikat), zaznaczeniu zaimportowanego certyfikatu i kliknięciu "Użyj wybranego certyfikatu". Zarówno Import jak i użycie certyfikatu wiąże się z monitem od kontrolera zabezpieczeń systemu Windows.

5. Poprawne logowanie kończy się komunikatem Uwierzytelnianie zakończone.

Program uzyskuje połączenie z KSeF na maksymalnie 7dni i przez ten czas może wystawiać faktury i wykonywać inne czynności w środowisku KSeF na koncie firmy i w imieniu uwierzytelnionej osoby.